Как пользоваться GEDmatch®Autosomal One-to-one Comparison*: простая пошаговая инструкция

*GEDmatch® — индивидуальное сравнение аутосом

Полезное видео на YouTube о том, как пользоваться инструментом для сравнения ДНК One to One.
Посмотреть видео

Сравниваю свой ДНК‑кит с возможным совпадающим образцом.

Ввожу только номера — всё остальное уже настроено по умолчанию. Система специально сделана простой для тех, кто ещё не разбирается глубоко в ДНК‑анализе и совпадении образцов.

 

Как только сравнение завершится, вы увидите окошко с результатами.

В самом верху будет написано, какие образцы вы сравнивали. Если совпадающий участник оставил электронную почту, она тоже отобразится — вы сможете написать ему при необходимости.

Чтобы вам было ещё удобнее, я показываю стрелкой, как в Яндекс Браузере перевести страницу, чтобы работать с интерфейсом GedMatch было проще.

 Давайте вместе разберём результаты!

1. Пролистайте страницу вниз. Вы увидите чередующиеся полосы — это визуальное представление данных.
2. Между полосами вы найдёте таблички — они появляются только при наличии совпадений.
3. В этих табличках содержится важная техническая информация:
   • количество сантиморганов (сМ), которые совпали;
   • другие технические детали о совпадающих участках.
4. Долистайте до самого конца — там вас ждут итоговые выводы:
   • самый большой совпадающий участок (в сантиморганах);
   • общее количество совпадающих фрагментов;
   • оценка системы о том, сколько поколений назад пересеклись ваши родословные линии.

Всё просто! Система сама обработала сложные данные и выдала их в понятном виде — вам остаётся только изучить результаты.

 

Как пользоваться GEDmatch® One‑to‑Many: простая пошаговая инструкция

GEDmatch® «один ко многим» / GEDmatch® One-to-Many

Полезное видео на YouTube о том, как использовать функцию «Один ко многим». Посмотреть видео

1. 1. Войдите в свой аккаунт
      Откройте сайт GEDmatch® и авторизуйтесь — введите логин и пароль.
   2. Перейдите в раздел One‑to‑Many
      В главном меню найдите и выберите пункт «One-to-Many» (или воспользуйтесь прямой ссылкой, если она у вас есть).
   3. Введите ID своего ДНК‑профиля
      В поле «Kit Number» укажите номер вашего ДНК‑кита (это уникальный идентификатор вашего образца).
   4. Задайте параметры поиска (по желанию)Minimum cM — минимальное количество сантиморганов для отображения совпадений.
      • По умолчанию: 7 сМ (подходит для первого анализа).
      • Для строгих фильтров: 15–20 сМ (меньше результатов, но выше достоверность).
        Остальные параметры (популяция, покрытие) можно оставить без изменений, если вы новичок.
   5. Запустите анализ
      Нажмите кнопку «Execute» (или «Submit»), чтобы начать поиск совпадений.
      
   6. Изучите таблицу результатов
      Вы увидите список совпадающих профилей с колонками:
      • Kit Number — ID профиля.
      • cM — общее количество сантиморганов совпадения.
      • Largest Segment — размер самого крупного совпадающего сегмента (в сМ).
      • Generation Estimate — оценка числа поколений до общего предка.
      • Email — может быть скрыт звёздочками (@.com).
   7. Что означают элементы интерфейса
      • Скрытый email — кликните по нему, чтобы увидеть реальный адрес (если пользователь разрешил раскрытие).
      • Значения в сМ — чем больше число, тем вероятнее близкое родство:
        • 20–30 сМ: возможное родство 3–4‑й степени (двоюродные/пятиюродные братья, дяди/тёти).
        • 50+ сМ: вероятное близкое родство (родители, братья, дети).
   8. Проанализируйте итоги
      1. • Самый крупный совпадающий сегмент (в сМ).
         • Общее количество совпадающих сегментов.
         • Примерную оценку, сколько поколений назад пересеклись ваши родословные (например, «4–6 поколений»).

 

Что значат красные ячейки overlap в GEDmatch® One‑to‑Many?

Красные (или розовые) ячейки в колонке Overlap в GEDmatch® One‑to‑Many сигнализируют о низком уровне перекрытия тестируемых участков ДНК между вами и совпадающим пользователем. Разберёмся, что это значит и насколько это важно.

 

Что такое «overlap» в GEDmatch

Overlap — это количество общих точек тестирования (SNP), которые обе компании‑провайдеры (ваша и вашего совпадения) проверили в ДНК.

• SNP (single nucleotide polymorphism) — это конкретные «точки» в геноме, где люди могут отличаться.
• Разные компании тестируют разные наборы SNP (обычно 600 000–700 000 точек на тест).
• GEDmatch может сравнивать только те участки, где SNP совпадают у обоих профилей.

Почему ячейка становится красной/розовой

Красный или розовый цвет появляется, когда число общих SNP невелико (ниже заданного порога). Это обычно вызвано:

1. Вы тестировались в разных компаниях
   Например:
   • вы — в AncestryDNA,
   • совпадающий пользователь — в 23andMe.
     У этих компаний разные наборы тестируемых SNP, поэтому общих точек мало.
2. Использованы разные версии чипов
   Даже внутри одной компании (например, AncestryDNA v1 vs v2) наборы SNP могут меняться — и перекрытие снижается.
3. Мало данных в профиле
   Если один из профилей загружен с неполным набором SNP, overlap будет низким.

Насколько это критично

• Не всегда плохо. Даже при низком overlap может быть значимое совпадение по cM (например, 800 cM). Цвет лишь указывает на методические ограничения, а не на отсутствие родства.
• Для дальних родственников низкий overlap чаще означает, что совпадение может быть случайным (IBC — identical by chance).
• Для близких родственников (родители, дети, братья) низкий overlap маловероятен — обычно у них тысячи общих SNP.

Что делать, если видите красную ячейку

1. Проверьте значение cM
   • Если cM высокое (например, > 500 cM), родство вероятно, несмотря на низкий overlap.
   • Если cM низкое (например, < 50 cM), совпадение может быть неинформативным.
2. Уточните, где тестировался совпадающий пользователь
   В профиле часто указано, какая компания и версия чипа использовались. Это поможет понять, почему overlap низкий.
3. Используйте One‑to‑One Autosomal
   В этом инструменте можно детально посмотреть, где именно совпадают сегменты, и оценить их надёжность.
4. Не игнорируйте совпадение сразу
   Иногда низкий overlap — просто артефакт разных методик тестирования. Если есть другие подсказки (например, общая фамилия), стоит исследовать дальше.

Важные нюансы

• Порог по умолчанию для окраски ячеек — 45 000 SNP. Если общих точек меньше, ячейка краснеет.
• Можно изменить порог в настройках One‑to‑Many (опции: 45 000, 56 250, 72 000, 90 000). Чем выше порог, тем строже фильтрация.
• Высокий overlap (например, > 200 000 SNP) обычно означает, что оба профиля тестировались в одной компании или на совместимых чипах.

Итог

Красная/розовая ячейка в Overlap — это предупреждение, а не приговор:

• Она говорит, что сравнение проводилось на ограниченном наборе данных.
• Если cM высокое, родство вероятно.
• Если cM низкое, совпадение может быть случайным.
• Для точной оценки используйте дополнительные инструменты GEDmatch (One‑to‑One, Chromosome Browser).